Si alguna vez has programado para web te abras topado con el problemas de las ñ y los acentos por no tener una codificación utf8. Tanto php como mysql y apache tienen que tener esta configuración en sus archivos.En esta caso voy a mostrar como configurar mysql.

El archivo que tenemos que editar es /etc/mysql/my.cnf y insertar en debajo de cada etiqueta las siguientes directivas:

[mysqld]
default-character-set=utf8
default-collation=utf8_general_ci
character-set-server=utf8
collation-server=utf8_general_ci
init-connect='SET NAMES utf8'

[client]
default-character-set=utf8

Una vez guardado reiniciamos mysql:

service mysql restart

También comprobamos que los cambios son correctos:

mysql> SHOW VARIABLES LIKE 'character_set%';
+--------------------------+----------------------------+
| Variable_name            | Value                      |
+--------------------------+----------------------------+
| character_set_client     | latin1                     | 
| character_set_connection | latin1                     | 
| character_set_database   | latin1                     | 
| character_set_filesystem | binary                     | 
| character_set_results    | latin1                     | 
| character_set_server     | latin1                     | 
| character_set_system     | utf8                       | 
| character_sets_dir       | /usr/share/mysql/charsets/ | 
+--------------------------+----------------------------+
8 rows in set (0.00 sec)